В Мюнстере это произошло трижды в период 1498-1522 годов. Неудивительно, что освобождение от налогов духовенства порождало самое живое недовольство. Торговцы и ремесленники жаловались на конкуренцию с монахами, занятыми в коммерции и индустриальной активности – людьми, у которых не было семей, нуждавшихся в поддержке, военной службы, которую нужно было нести, правил гильдий, которые необходимо было соблюдать, и на стороне которых были все мыслимые и немыслимые преимущества.
В XVI веке центр сопротивления епископу и колледжу находился не в городском совете, трансформировавшемуся в умеренный и относительно консервативный организм, но в гильдиях. Это определенно верно в отношении Мюнстера. Город в течение XV века превратился важный коммерческий центр и стал членом Ганзейской Лиги, и гильдии приобрели большую политическую власть. Они были организованы одну большую объединенную гильдию, в состав которой входило шестнадцать гильдий и могли , при подходящем случае, поднять все население против клира. Одним из таких случаев стала Крестьянская Война. Наиболее поразительный факт истории того периода заключается в том, что в тот момент, когда революционное возбуждение распространилось из южной Германии на северо-запад, ни крестьянство светских княжеств, ни светские города не поднялись на мятеж – но исключительно столицы епископских государств: Оснабрюк, Утрехт, Падерборн и Мюнстер. В Мюнстере гильдии возглавили атаку против монастыря, вступившего в коммерческую конкуренцию с ними. Они также потребовали общих ограничений привилегий духовенства и капитул был вынужден пойти на уступки.
В этом случае триумф гильдий продолжался недолго – и в Мюнстере, и в других городах. Как только принцы нанесли поражение крестьянам на юге, капитулы северных епархий сумели восстановить всю потерянную власть. Они немедленно отменили все уступки, сокрушили любые попытки реформ и сделали все, чтобы унизить мятежников. В 1530 году старая система управления была восстановлена во всех епископских княжествах. Несмотря на это, она была куда менее надежной чем ранее, потому что горожане ненавидели всемогущество духовенства и знати. Они осознали идею собственной силы, и только ждали подходящего момента для того, чтобы применить ее снова. Для многих ситуация в эти годы была совершенно отчаянной. В 1529 году эпидемия Черной Смерти опустошила Вестфалию, и одновременно на страну обрушился неурожай. Между 1529 и 1530 цены на рожь выросли почти в три раза. В конце 1530 был введен экстраординарный налог для организации сопротивления турецкому вторжению в восточные территории империи. Существуют все свидетельства того, что в начале 1530-х годов лишения в северо-западной Германии стали невыносимыми. Все ждали беспорядков в том или ином епископском княжестве, и когда в 1530 году епископ Мюнстера решил продать свою епархию епископу Падерборна и Оснабрюка и, в результате, потерял союзников в капитуле – начались беспорядки.